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SnapGene(分子生物学工具)官方版 7.1.05 最新版

SnapGene(分子生物学工具)官方版 7.1.05 最新版

  • 软件大小:119.78 MB
  • 更新日期:2023-12-12
  • 软件语言:英文软件
  • 软件类别:行业软件
  • 软件授权:免费软件
  • 评分等级:
  • 适用平台:Win All
  • 软件来源:网络收集
本地下载 文件大小:119.78 MB
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SnapGene官方版是一款功能强大的分子生物学软件,专业权威。该软件模拟了Clontech的In-Fusion克隆技术,只需选择想要融合的DNA片段即可设计引物,是一种通用的无缝基因融合方法。软件能够直观地进行注释分析和DNA图谱,用于创建和共享注释文件,帮助我们清晰准确地为分子生物学绘制相关图形。该软件还支持多种数据格式,提供了许多高级功能,如自动序列比对、限制性酶消化模拟等。SnapGene官方版的用户界面简洁易用,使得分子生物学工作变得更加高效。

SnapGene(分子生物学工具)官方版 7.1.05 最新版

软件特色

1、In-Fusion 克隆
Clontech的In-Fusion克隆技术是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。SnapGene是第一个模拟此程序的软件。只需选择您想要融合的DNA片段,SnapGene即可设计引物。
2、GibsonAssembly
许多研究人员转向吉布森大会,不使用限制性内切酶将片段插入质粒。通过PCR扩增待连接的DNA片段以产生重叠末端。SnapGene简化了吉布森装配反应的计划,并自动化了底漆设计。
3、限制性克隆
SnapGene独特的限制克隆界面以干净的布局显示您需要的信息。规划克隆程序从未如此简单。如果你已经知道你想要做什么,克隆模拟只需要几秒钟。如果克隆程序存在设计缺陷,则可以在模拟过程中捕获并纠正错误。
4、PCR&诱变 
设计引物后,可用它们来模拟常规PCR,重叠延伸PCR或诱变。产生的DNA序列文件立即可用于进一步操作。与限制性克隆界面一样,针对引物的界面以直观的方式显示关键信息。
5、自动文档 
SnapGene最令人惊奇的地方在于它会自动记录克隆项目中的步骤。每次编辑序列或模拟克隆或PCR或诱变时,该程序都会自动记录在图形历史记录中。在模拟DNA构建体的创建之后,您可以将历史记录用作实验方案。嵌入在最终文件中的是所有的祖先构造,其中的每一个都可以作为单独的文件复活。

使用教程

限制性克隆的技巧
对于许多应用,常规限制性克隆仍然是最好的方法。一些简单的技巧将有助于确保您的克隆顺利进行。
1、一般技巧
首先,在程序的每一步都要小心。从长远来看,这种方法可以节省时间。
确保DNA非常干净。当制备载体或切除待插入的片段时,从约2μg的DNA开始。
每次酶促反应后,用旋转柱纯化DNA。在40-45μl的10mM Tris(pH8.5)中洗脱DNA,然后进行下一步反应。(在用凝胶纯化DNA片段之前不需要使用旋转柱。)
为了最大限度地提高效率,请尽量减少程序中的步骤数。例如,将钝端片段克隆到钝性载体位点(例如SmaI位点)比将其用Klenow或T4 DNA聚合酶钝化的位点更好。
如有疑问,用凝胶纯化DNA片段。更清洁的起始材料将产生更好的结果。
2、准备矢量
限制性克隆最常见的问题是在手术后恢复起始载体。该问题有两个原因:载体的不完全消化,以及切割载体与其自身的重新连接。下面描述的技巧将最大限度地减少这些影响。
确保载体的消化完成。使用过量的限制酶(约20 U,2μgDNA),消化约4小时。如果载体需要用两种具有不同最佳反应缓冲液的酶切割,则依次进行消化,并在其间进行旋转柱纯化。
消化载体(并且如果合适的话钝化),用磷酸酶处理:在37℃下1小时处于5'突出端,或者如果DNA具有任何平末端或3'突出端则在50℃处理1小时。
用旋转柱除去磷酸酶。通常不需要对载体进行凝胶纯化,因为磷酸酶处理会使产生的任何额外DNA片段失活。
3、使用载体,确保消化和磷酸酶反应完成。彻底和反复地涡旋混合物,并且不允许任何液滴逃脱酶处理。在涡旋后短暂旋转以确保管侧没有留下液滴是个好主意。
准备插入的片段
为了制备插入的片段,不完全消化不是一个严重的问题,因为片段的部分回收是可接受的。您可以使用相对较短的消化时间,对于双重消化,您可以使用对一种或两种酶来说不是最理想的反应缓冲液。
用凝胶纯化插入的片段。除去除不需要的或不完全消化的DNA外,该方法还可去除酶和小分子。当用透照仪观察DNA条带时,不要使用312nm或更低的短波紫外线,因为DNA会受到严重损害。请改用360-365 nm紫外灯。
如果通过PCR产生插入的片段,则在进行任何限制性消化之前用凝胶或旋转柱纯化。如果您计划将平末端PCR片段(用聚合酶如Pfu产生)克隆到磷酸酶处理的载体中,请确保您的PCR引物含有5'-磷酸。
结扎和转化
使用磷酸酶处理的载体,进行对照连接,其中省略插入的片段。该对照连接应该产生非常少的转化体,因为只有环状DNA分子有效地转化大肠杆菌,并且在不与磷酸化片段连接的情况下不能发生载体的再环化。
如果DNA仅有粘性末端,则在室温下连接约1小时。如果DNA具有任何平端,则在室温下连接约4小时并使用高浓度T4连接酶。
微量制作和诊断摘要
如果您使用插入的片段获得了比用于对照连接的结扎更多的转化体,那么您的克隆几乎肯定会起作用,并且您通常只能制作3-4个小量制备物。
在执行小量制备的诊断限制摘要时,始终包括起始向量作为参考标准。

软件优点

为学生,博士后和技术人员带来的好处
工作更快,更聪明
SnapGene 使您的 DNA 操作易于可视化和模拟,并在错误发生之前提醒您。
保持记录不费吹灰之力
SnapGene 中的每个 DNA 操作都会自动记录,因此您可以准确地看到您所做的操作并检索祖先结构的序列。
随时随地学习
如果您不熟悉克隆或特定技术,丰富直观的 SnapGene 界面可帮助您了解其工作原理。
轻松与世界各地的同事共享数据
SnapGene 的 .dna 文件可以通过免费的跨平台 SnapGene Viewer 打开,使您能够与同事共享丰富的带注释的地图和序列。
PI 和实验室管理器的好处
更快地获得结果
实验室中的人员将不再使用有缺陷的克隆程序浪费时间,并将在第一时间开始获得正确的构造。
花更少的时间教人们如何克隆
SnapGene 是一个很好的教学工具,甚至新手克隆人也会很快学会如何自己解决问题。
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